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Este estudio expande la base de datos AlphaFold para incluir 1,8 millones de estructuras de complejos proteicos de alta confianza a escala proteómica, proporcionando un recurso fundamental para descubrir nuevas topologías y facilitar la investigación funcional en biología.
Este artículo presenta un método práctico y compatible con laboratorios de biología para sintetizar surfactantes fluorados basados en éteres perfluoropolialquilicos (PFPE) mediante acoplamiento directo, lo que permite a los investigadores generar materiales funcionales a medida para diversas aplicaciones en microfluídica de gotas sin depender de reactivos comerciales costosos.
Los autores presentan la versión 2 del método de matriz de ARNt, una mejora que mediante modificaciones de secuencia y la introducción de una secuencia líder permite la síntesis simultánea in vitro de 21 ARNt con una actividad traduccional comparable a la de los ARNt preparados individualmente, superando así las limitaciones de la versión anterior.
Los investigadores desarrollaron un sistema de protocélulas en vesículas lipídicas donde el control óptico de la polimerización de actina, requiriendo tanto redes ramificadas como lineales, impulsa extensiones de membrana y movimiento direccional, estableciendo una plataforma fundamental para el diseño de células sintéticas activas y sistemas de entrega autónomos.
Este estudio revela que la atenuación transitoria de la contractilidad celular reprograma a las células epiteliales hacia un estado impulsado por protrusiones mediante la remodelación coordinada de la mecánica y la señalización de ERK, lo que desencadena la fluidización del tejido y el flujo colectivo persistente.
Este estudio demuestra que la ingeniería de las fibras curli de *E. coli* Nissle 1917 mediante la fusión con el antagonista SSL3, en lugar del blindaje estérico, permite inhibir eficazmente la activación del receptor TLR2 y modular la respuesta inmune innata, estableciendo una plataforma programable para controlar las interacciones huésped-microbio en superficies mucosas.
Este estudio demuestra que la combinación de manipulación líquida automatizada y aprendizaje activo permite optimizar eficientemente la composición del sistema PURE, logrando mejoras significativas en el rendimiento de proteínas y revelando que las condiciones óptimas dependen tanto de la concentración de ADN como del contexto genético específico.
Este estudio demuestra que una estrategia de control metabólico dinámico en dos etapas, que combina la regulación de flujos de NADPH y la modulación de vías competitivas, permitió a una cepa de *E. coli* optimizada producir 140 g/L de etilenglicol a partir de xilosa en biorreactores por lotes alimentados, alcanzando el 92% del rendimiento teórico.
Los autores desarrollan un ARN guía condicional activado por un intrón endógeno que permite editar el gen IL2RG solo en células que lo expresan, mejorando así la precisión y reduciendo los efectos fuera de objetivo en aplicaciones de edición genética in vivo.
CombinGym es una plataforma de referencia que introduce 14 conjuntos de datos de mutagénesis combinatoria para evaluar algoritmos de aprendizaje automático, demostrando que los datos de mutaciones de bajo orden mejoran la predicción de variantes de alto orden y validando este enfoque mediante simulaciones y experimentos de ingeniería de proteínas.
Los autores desarrollaron interruptores lógicos AND robustos en *Escherichia coli* mediante la ingeniería sistemática de promotores combinatorios que integran señales de múltiples factores de transcripción, estableciendo reglas de diseño basadas en la supresión de estados parcialmente inducidos y la gestión de la orientación de los operadores para superar desafíos como la fugacidad basal y las dependencias del contexto genético.
Este estudio demuestra que la expresión de transportadores heterólogos en *Lacticaseibacillus rhamnosus* GG supera las limitaciones de transporte de sustratos y aumenta significativamente la actividad de la fenilalanina amonio liasa (AvPAL*) para el tratamiento de la fenilcetonuria, mientras que el tratamiento con surfactantes químicos no logró mejorar la tasa de reacción.
El marco Cepeda es un programa de investigación preclínica modular y centrado en la seguridad, desarrollado mediante 21.000 ciclos de simulación computacional, que propone una arquitectura de reprogramación epigenética parcial coordinada para abordar las 12 marcas oficiales del envejecimiento mediante un diseño de "defensa en profundidad" con nueve mecanismos de seguridad para prevenir la pluripotencia no controlada.
Este estudio caracteriza por primera vez en *Zymomonas mobilis* un conjunto de siete promotores inducibles químicamente compatibles con el sistema Zymo-Parts, identificando a los pares VanRAM-PvanCC y CinRAM-Pcin como las opciones más prometedoras para la ingeniería metabólica en esta bacteria.
Este estudio demuestra que bacterias *Escherichia coli* ingenierizadas pueden implementar una regla de aprendizaje local genéticamente codificada que permite el entrenamiento físico de redes neuronales biológicas mediante la modificación de ratios de copias de plásmidos, logrando así la adaptación supervisada y la computación multicelular autónoma.
Este estudio demuestra que las cáscaras de microcompartimentos bacterianos, acopladas mediante el sistema SpyCatcher-SpyTag, constituyen una plataforma modular y robusta que permite encapsular, estabilizar y reactivar múltiples enzimas funcionales, incluyendo su co-encapsulación para el reciclaje de cofactores, facilitando así la ingeniería de vías metabólicas complejas.
Este estudio presenta una plataforma integral en *Cupriavidus necator* que optimiza la transformación genética, diversifica las propiedades de los polihidroxialcanoatos (PHA) mediante variantes de sintasas, mejora la sostenibilidad del proceso mediante co-cultivos y funcionaliza las nanopartículas de PHA con tecnología SpyTag-SpyCatcher para aplicaciones en biomanufactura, biosensores y administración de fármacos.
Este estudio demuestra que la eficiencia de edición de CRISPR-Cas9 depende fuertemente del contexto biológico y varía entre especies, lo que invalida la existencia de un modelo universal y subraya la necesidad de utilizar datos endógenos diversos para mejorar el diseño de guías.
Los autores retiraron este manuscrito porque no pudieron confirmar la bioactividad de los péptidos aislados, ya que estos estaban contaminados con antibióticos utilizados en el proceso de producción.
Este artículo presenta un kit de vectores estandarizado y mejorado que facilita la implementación del método mSwAP-In para la escritura iterativa de genomas en células madre de mamíferos, permitiendo la integración de grandes cargas de ADN mediante herramientas de ensamblaje versátiles y sistemas de selección optimizados.